Први јутарњи урин се узима после ноћног гладовања, а за његово правилно узимање неопходна је одговарајућа хигијена пацијента која подразумева јутарње прање само са водом пре уринирања како би се избегла контаминација узорка бактеријама.
Прање сапуном и средствима на бази антисептика се не препоручује. Први млаз се одбацује, зато што је увек контаминиран постојећом уретралном флором. Следећи млаз се сакупља у чисте, суве и стерилне пластичне посуде за урин. Последњи млаз се такође одбацује. Количина сакупљеног урина од 50 – 100 мл је довољна за извођење анализа. Узорак урина који стигне у лабораторију мора бити свеж зато што се стајањем развијају бактерије и мења физичко – хемијски састав урина. Уколико се урин узима у кућним условима, треба га што пре донети у лабораторију. Од момента узимања узорка, испитивање урина се мора обавити најкасније у току 2 сата. У супротном, узорак се сматра неисправним и не узима у рад па је неопходно донети нови узорак. Дан пре узимања урина треба избегавати повећану физичку активност. Физичко вежбање као и гладовање изазвано разним дијетама могу значајно да утичу на хемијски састав урина. Уколико је могуће јутарњу дозу лекова треба узети после мокрења.