MRI преглед ендокранијума представља преглед мозга и свих ендокранијалних структура.
Могу се уочити органска оштећења можданог паренхима, демијелинационих оштећења у склопу мултипле склерозе, интракранијалне хеморагије (крварења) у најранијој фази. Посебним секвенцама је могућа детекција исхемијских и трауматских оштећења.